Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CC2D2AQ9P2K1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms