Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms