Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms