Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms