Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXL2Q9NZ53 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXL2Q9NZ53 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms