Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA3

GOLGA6A, Golgin subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6AQ9NYA3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6AQ9NYA3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms