Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX00

TMEM160, Transmembrane protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM160Q9NX00 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM160Q9NX00 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM160Q9NX00 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM160Q9NX00 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM160Q9NX00 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms