Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms