Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms