Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms