Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL17Q9NRX2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms