Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms