Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms