Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC52A2Q9HAB3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC52A2Q9HAB3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms