Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1D9

POLR3F, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3FQ9H1D9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3FQ9H1D9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms