Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms