Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms