Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms