Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms