Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCAPERQ9BY12 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCAPERQ9BY12 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms