Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms