Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C16orf70Q9BSU1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C16orf70Q9BSU1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms