Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms