Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms