Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNAQ96QF7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms