Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf72Q96LT7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C9orf72Q96LT7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C9orf72Q96LT7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C9orf72Q96LT7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C9orf72Q96LT7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C9orf72Q96LT7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C9orf72Q96LT7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C9orf72Q96LT7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C9orf72Q96LT7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C9orf72Q96LT7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf72Q96LT7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf72Q96LT7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf72Q96LT7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms