Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
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