Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJD4Q96KN9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD4Q96KN9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD4Q96KN9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD4Q96KN9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD4Q96KN9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD4Q96KN9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD4Q96KN9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD4Q96KN9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD4Q96KN9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD4Q96KN9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD4Q96KN9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD4Q96KN9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD4Q96KN9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD4Q96KN9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD4Q96KN9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD4Q96KN9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJD4Q96KN9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJD4Q96KN9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms