Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CHAMP1Q96JM3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms