Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms