Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCANQ96GW7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms