Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms