Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms