Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms