Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms