Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL3Q8N8U3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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