Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z2

ABRA, Actin-binding Rho-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAQ8N0Z2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABRAQ8N0Z2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms