Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD2Q8IZ73 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms