Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVJ8

APRG1, AP20 region protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APRG1Q8IVJ8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APRG1Q8IVJ8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms