Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPBP1Q86WP2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms