Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.6 ms