Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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