Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms