Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C16orf54Q6UWD8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms