Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms