Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC174Q6PII3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms