Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms