Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SOGA3Q5TF21 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms