Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM78Q5T7P6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms