Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAPCD1Q5SSQ6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms